36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3624 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  100 
 
 		 318 aa  641    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  62.22 
 
 		 325 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  60.06 
 
 		 327 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  60.06 
 
 		 327 aa  391  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  59.31 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  60.06 
 
 		 318 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1320  rubrerythrin  59.75 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4784  Rubrerythrin  60.06 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  57.59 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3902  rubrerythrin  59.13 
 
 		 323 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  58.2 
 
 		 323 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4072  rubrerythrin  60.25 
 
 		 327 aa  368  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662924  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3260  rubrerythrin  60.38 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3115  Rubrerythrin  60.06 
 
 		 319 aa  364  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0107  ferritin-like protein  59.18 
 
 		 323 aa  357  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4264  Rubrerythrin  57.91 
 
 		 327 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  54.26 
 
 		 330 aa  351  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0196  hypothetical protein  55.06 
 
 		 327 aa  350  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.057025  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  54.26 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  53.94 
 
 		 330 aa  349  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4529  Rubrerythrin  56.65 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  55.73 
 
 		 323 aa  336  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2011  hypothetical protein  50.79 
 
 		 325 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2509  rubrerythrin  56.13 
 
 		 325 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0850  hypothetical protein  56.13 
 
 		 325 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155154  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  53.56 
 
 		 323 aa  320  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3480  rubrerythrin  54.89 
 
 		 327 aa  310  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7563  protein of unknown function DUF125 transmembrane  57.89 
 
 		 322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0891  hypothetical protein  62.21 
 
 		 178 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0271275 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0180  hypothetical protein  63.87 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2546  hypothetical protein  58.58 
 
 		 174 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344069  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2719  protein of unknown function DUF125 transmembrane  57.4 
 
 		 175 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228189  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1435  hypothetical protein  57.06 
 
 		 172 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0875  protein of unknown function DUF125 transmembrane  56.72 
 
 		 163 aa  143  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  29.52 
 
 		 175 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  29.7 
 
 		 175 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.386737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>