35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0196 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0196  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  673    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.057025  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4529  Rubrerythrin  79.51 
 
 		 327 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4264  Rubrerythrin  78.29 
 
 		 327 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  69.63 
 
 		 327 aa  474  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  70.55 
 
 		 327 aa  475  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  69.63 
 
 		 327 aa  474  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3480  rubrerythrin  73.31 
 
 		 327 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4072  rubrerythrin  68.71 
 
 		 327 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662924  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  66.25 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  65.93 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  66.25 
 
 		 330 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0107  ferritin-like protein  66.46 
 
 		 323 aa  414  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2011  hypothetical protein  61.99 
 
 		 325 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0850  hypothetical protein  66.67 
 
 		 325 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2509  rubrerythrin  66.67 
 
 		 325 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  57.28 
 
 		 318 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  60.44 
 
 		 323 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  58.75 
 
 		 323 aa  363  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  58.28 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3902  rubrerythrin  57.37 
 
 		 323 aa  355  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4784  Rubrerythrin  58.62 
 
 		 323 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1320  rubrerythrin  58.54 
 
 		 345 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  55.06 
 
 		 318 aa  333  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3115  Rubrerythrin  52.85 
 
 		 319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  53.92 
 
 		 323 aa  326  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  53.75 
 
 		 323 aa  319  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3260  rubrerythrin  54.75 
 
 		 318 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7563  protein of unknown function DUF125 transmembrane  55.52 
 
 		 322 aa  278  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0180  hypothetical protein  68.64 
 
 		 267 aa  243  3e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0891  hypothetical protein  66.26 
 
 		 178 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0271275 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2719  protein of unknown function DUF125 transmembrane  58.82 
 
 		 175 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228189  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1435  hypothetical protein  53.33 
 
 		 172 aa  162  7e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2546  hypothetical protein  57.14 
 
 		 174 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0875  protein of unknown function DUF125 transmembrane  53.21 
 
 		 163 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  30.57 
 
 		 175 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.386737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>