34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0891 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0891  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  343  7e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0271275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  71.17 
 
 
323 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  63.58 
 
 
327 aa  211  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  63.58 
 
 
327 aa  211  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0107  ferritin-like protein  69.14 
 
 
323 aa  209  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  62.5 
 
 
325 aa  208  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4784  Rubrerythrin  69.77 
 
 
323 aa  207  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667039  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0196  hypothetical protein  66.26 
 
 
327 aa  206  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.057025  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1320  rubrerythrin  68.02 
 
 
345 aa  205  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  64.5 
 
 
327 aa  204  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3902  rubrerythrin  68.9 
 
 
323 aa  204  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2011  hypothetical protein  61.05 
 
 
325 aa  202  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  68.1 
 
 
323 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7563  protein of unknown function DUF125 transmembrane  75.31 
 
 
322 aa  201  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  69.14 
 
 
323 aa  201  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  65.85 
 
 
318 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  66.26 
 
 
323 aa  198  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0850  hypothetical protein  66.05 
 
 
325 aa  195  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2509  rubrerythrin  66.05 
 
 
325 aa  195  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  63.31 
 
 
330 aa  194  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  62.13 
 
 
330 aa  192  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  62.13 
 
 
330 aa  192  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4072  rubrerythrin  65 
 
 
327 aa  191  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662924  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  62.57 
 
 
318 aa  191  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0180  hypothetical protein  59.17 
 
 
267 aa  190  8e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3480  rubrerythrin  64.02 
 
 
327 aa  187  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233561  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4264  Rubrerythrin  65.22 
 
 
327 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4529  Rubrerythrin  65.84 
 
 
327 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3260  rubrerythrin  66.28 
 
 
318 aa  175  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3115  Rubrerythrin  59.76 
 
 
319 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2719  protein of unknown function DUF125 transmembrane  57.49 
 
 
175 aa  156  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228189  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1435  hypothetical protein  54.66 
 
 
172 aa  151  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2546  hypothetical protein  56.47 
 
 
174 aa  148  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0875  protein of unknown function DUF125 transmembrane  51.75 
 
 
163 aa  122  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.692724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>