34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2546 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2546  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  333  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344069  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2719  protein of unknown function DUF125 transmembrane  76.3 
 
 		 175 aa  248  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  59.04 
 
 		 325 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  56.63 
 
 		 330 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  60.78 
 
 		 318 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  58.58 
 
 		 318 aa  181  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0196  hypothetical protein  57.14 
 
 		 327 aa  181  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.057025  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  53.85 
 
 		 330 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  53.85 
 
 		 330 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2011  hypothetical protein  60.26 
 
 		 325 aa  177  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  56.79 
 
 		 327 aa  177  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4072  rubrerythrin  60.53 
 
 		 327 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662924  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  54.94 
 
 		 327 aa  175  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  54.94 
 
 		 327 aa  175  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3115  Rubrerythrin  58.33 
 
 		 319 aa  173  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3480  rubrerythrin  56.17 
 
 		 327 aa  173  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0107  ferritin-like protein  59.48 
 
 		 323 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1435  hypothetical protein  57.52 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0891  hypothetical protein  56.47 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0271275 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0850  hypothetical protein  57.62 
 
 		 325 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2509  rubrerythrin  57.62 
 
 		 325 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  57.59 
 
 		 323 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4529  Rubrerythrin  58.55 
 
 		 327 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4264  Rubrerythrin  57.89 
 
 		 327 aa  158  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0180  hypothetical protein  51.9 
 
 		 267 aa  157  7e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4784  Rubrerythrin  57.23 
 
 		 323 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1320  rubrerythrin  56.63 
 
 		 345 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  54.65 
 
 		 323 aa  154  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3902  rubrerythrin  57.69 
 
 		 323 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  58.97 
 
 		 323 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  54.49 
 
 		 323 aa  150  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3260  rubrerythrin  59.12 
 
 		 318 aa  150  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0875  protein of unknown function DUF125 transmembrane  56.77 
 
 		 163 aa  141  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7563  protein of unknown function DUF125 transmembrane  60.9 
 
 		 322 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>