37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0850 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0850  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  645    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2509  rubrerythrin  100 
 
 		 325 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  72.81 
 
 		 330 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  72.81 
 
 		 330 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  71.88 
 
 		 330 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0107  ferritin-like protein  73.35 
 
 		 323 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0196  hypothetical protein  65.14 
 
 		 327 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.057025  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  66.15 
 
 		 327 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  66.77 
 
 		 327 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  66.15 
 
 		 327 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4529  Rubrerythrin  67.81 
 
 		 327 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4264  Rubrerythrin  67.81 
 
 		 327 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4072  rubrerythrin  68.77 
 
 		 327 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2011  hypothetical protein  63.95 
 
 		 325 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3480  rubrerythrin  69.72 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  58.73 
 
 		 318 aa  362  4e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  59.49 
 
 		 325 aa  358  6e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  57.19 
 
 		 323 aa  344  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1320  rubrerythrin  56.75 
 
 		 345 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4784  Rubrerythrin  58.49 
 
 		 323 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667039  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3902  rubrerythrin  57.55 
 
 		 323 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  55.87 
 
 		 318 aa  334  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  55 
 
 		 323 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3115  Rubrerythrin  56.19 
 
 		 319 aa  320  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3260  rubrerythrin  56.83 
 
 		 318 aa  318  6e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  55 
 
 		 323 aa  300  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  53.44 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7563  protein of unknown function DUF125 transmembrane  56.23 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0180  hypothetical protein  71.52 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0891  hypothetical protein  66.05 
 
 		 178 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0271275 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2719  protein of unknown function DUF125 transmembrane  56.17 
 
 		 175 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228189  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1435  hypothetical protein  55.03 
 
 		 172 aa  152  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2546  hypothetical protein  57.62 
 
 		 174 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0875  protein of unknown function DUF125 transmembrane  55.56 
 
 		 163 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01610  chitin synthase-related  27.98 
 
 		 1895 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  23.78 
 
 		 170 aa  47.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  29.93 
 
 		 185 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>