38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7563 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7563  protein of unknown function DUF125 transmembrane  100 
 
 		 322 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1320  rubrerythrin  63.78 
 
 		 345 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3902  rubrerythrin  63.16 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4784  Rubrerythrin  63.47 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  61.61 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  61.3 
 
 		 323 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  59.38 
 
 		 318 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  59.19 
 
 		 325 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  58.64 
 
 		 330 aa  345  5e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  56.74 
 
 		 327 aa  344  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  58.33 
 
 		 330 aa  343  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  58.02 
 
 		 330 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0196  hypothetical protein  56.11 
 
 		 327 aa  342  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.057025  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  54.32 
 
 		 327 aa  340  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  54.32 
 
 		 327 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0107  ferritin-like protein  57.94 
 
 		 323 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  58.51 
 
 		 323 aa  339  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  55.73 
 
 		 318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  57.59 
 
 		 323 aa  336  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3260  rubrerythrin  60.31 
 
 		 318 aa  333  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4529  Rubrerythrin  57.94 
 
 		 327 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4072  rubrerythrin  56.52 
 
 		 327 aa  329  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662924  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4264  Rubrerythrin  57.32 
 
 		 327 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2011  hypothetical protein  52.48 
 
 		 325 aa  322  6e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0850  hypothetical protein  57.28 
 
 		 325 aa  319  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2509  rubrerythrin  57.28 
 
 		 325 aa  319  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3115  Rubrerythrin  50.46 
 
 		 319 aa  291  8e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3480  rubrerythrin  55.21 
 
 		 327 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0891  hypothetical protein  72.73 
 
 		 178 aa  249  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0271275 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0180  hypothetical protein  49.55 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2719  protein of unknown function DUF125 transmembrane  59.62 
 
 		 175 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2546  hypothetical protein  58.9 
 
 		 174 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344069  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1435  hypothetical protein  56.49 
 
 		 172 aa  158  9e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0875  protein of unknown function DUF125 transmembrane  55 
 
 		 163 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  27.07 
 
 		 170 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  28.67 
 
 		 150 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  28.67 
 
 		 151 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0815  rubrerythrin  36.78 
 
 		 175 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>