25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2957 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2957  Rubrerythrin  100 
 
 
179 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2723  rubrerythrin  44.91 
 
 
167 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0811811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1530  rubrerythrin  44.31 
 
 
178 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88672  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0695  rubrerythrin  41.92 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289242  normal  0.0810169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0478  hypothetical protein  37.25 
 
 
151 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2337  hypothetical protein  36.18 
 
 
159 aa  95.5  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3779  rubrerythrin  32.68 
 
 
163 aa  91.7  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2138  hypothetical protein  32.89 
 
 
162 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942475  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0286  rubrerythrin  32.24 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3445  hypothetical protein  31.54 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35818  normal  0.0368438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1839  hypothetical protein  32.21 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2009  hypothetical protein  30.87 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  30.92 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10560  ferritin-like protein  33.77 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.639396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6006  hypothetical protein  34.03 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00787853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10400  hypothetical protein  28.66 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  30.67 
 
 
302 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  29.33 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  29.87 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  31.9 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  30.67 
 
 
174 aa  57.4  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2379  rubrerythrin  31.21 
 
 
337 aa  55.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  29.45 
 
 
174 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  24.67 
 
 
150 aa  44.7  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  25.15 
 
 
175 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.386737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>