25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10400 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_10400  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  316  7e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10560  ferritin-like protein  66.23 
 
 		 152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.639396  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1839  hypothetical protein  43.24 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2009  hypothetical protein  41.22 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2138  hypothetical protein  41.22 
 
 		 162 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942475  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2337  hypothetical protein  41.1 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0286  rubrerythrin  41.78 
 
 		 174 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3779  rubrerythrin  41.22 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3445  hypothetical protein  39.86 
 
 		 162 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35818  normal  0.0368438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  39.04 
 
 		 302 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2723  rubrerythrin  41.1 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0811811  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  41.22 
 
 		 302 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  39.19 
 
 		 301 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  39.44 
 
 		 301 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0478  hypothetical protein  39.13 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0695  rubrerythrin  36.84 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289242  normal  0.0810169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2957  Rubrerythrin  28.66 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1530  rubrerythrin  29.14 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2379  rubrerythrin  29.93 
 
 		 337 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  27.66 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  27.66 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  24.29 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  27.27 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  28.26 
 
 		 318 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  28.67 
 
 		 363 aa  40.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>