16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2379 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2379  rubrerythrin  100 
 
 
337 aa  651    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6006  hypothetical protein  46.84 
 
 
286 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00787853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2863  rubrerythrin  39.88 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1530  rubrerythrin  33.78 
 
 
178 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88672  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2957  Rubrerythrin  31.25 
 
 
179 aa  56.2  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0478  hypothetical protein  31.16 
 
 
151 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10400  hypothetical protein  29.58 
 
 
155 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  30.19 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0286  rubrerythrin  30.67 
 
 
174 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2349  hypothetical protein  26.97 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2009  hypothetical protein  27.66 
 
 
162 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3445  hypothetical protein  26.95 
 
 
162 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35818  normal  0.0368438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1839  hypothetical protein  28.87 
 
 
162 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2138  hypothetical protein  25.53 
 
 
162 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942475  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10560  ferritin-like protein  34.15 
 
 
152 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.639396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  29.56 
 
 
301 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>