34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1881 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  100 
 
 		 174 aa  348  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  98.85 
 
 		 174 aa  343  7e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  94.86 
 
 		 175 aa  325  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  69.54 
 
 		 175 aa  242  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2723  rubrerythrin  29.88 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0811811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1530  rubrerythrin  30.97 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0815  rubrerythrin  28.05 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0478  hypothetical protein  31.21 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2957  Rubrerythrin  29.45 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10560  ferritin-like protein  30.77 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.639396  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3779  rubrerythrin  28.06 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2337  hypothetical protein  30.71 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2009  hypothetical protein  28.26 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.62 
 
 		 323 aa  49.3  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  29.17 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10400  hypothetical protein  27.66 
 
 		 155 aa  48.5  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0286  rubrerythrin  25.97 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2138  hypothetical protein  25.55 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942475  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3445  hypothetical protein  27.54 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35818  normal  0.0368438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1839  hypothetical protein  23.94 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0478  hypothetical protein  25.66 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1416  Rubrerythrin  27.7 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10412e-25 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0695  rubrerythrin  27.35 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289242  normal  0.0810169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  30.06 
 
 		 330 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  30.06 
 
 		 330 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  23.94 
 
 		 302 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  31.47 
 
 		 323 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  30.67 
 
 		 330 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2863  rubrerythrin  26.62 
 
 		 272 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0941  rubrerythrin  25.64 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00913013  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  28.48 
 
 		 318 aa  41.6  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  26.32 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  31.15 
 
 		 164 aa  41.2  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  23.97 
 
 		 301 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>