55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0207 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  100 
 
 
373 aa  750    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  53.35 
 
 
358 aa  352  5e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  52.12 
 
 
352 aa  350  2e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  48.52 
 
 
359 aa  301  1e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  28.87 
 
 
346 aa  110  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  58.06 
 
 
96 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1504  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.49 
 
 
270 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0890  hypothetical protein  51.04 
 
 
94 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000110299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0417  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.36 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  45.83 
 
 
94 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3018  Linocin_M18 bacteriocin protein  28.85 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1095  Linocin_M18 bacteriocin protein  28.31 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.236732  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0627  hypothetical protein  50 
 
 
101 aa  72.4  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1283  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.45 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0692096  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1211  hypothetical protein  46.15 
 
 
103 aa  70.5  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000304169  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0884  Rubrerythrin  64.81 
 
 
97 aa  70.1  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00115612  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1800  hypothetical protein  47.44 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463849  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1010  hypothetical protein  44.83 
 
 
101 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1164  hypothetical protein  37.93 
 
 
102 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527792  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0817  hypothetical protein  47.37 
 
 
101 aa  68.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2056  hypothetical protein  41.67 
 
 
123 aa  67  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0119  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.51 
 
 
278 aa  67  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000660345  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4294  hypothetical protein  41.11 
 
 
102 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00503085  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2055  hypothetical protein  41.67 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2029  hypothetical protein  42.35 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1061  hypothetical protein  42.7 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2827  hypothetical protein  44.74 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1064  hypothetical protein  50 
 
 
77 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  39.36 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1148  hypothetical protein  43.9 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0856  hypothetical protein  45.07 
 
 
102 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.354631  hitchhiker  0.0042327 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3055  hypothetical protein  42.25 
 
 
112 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7404  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3017  hypothetical protein  39.77 
 
 
123 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.85648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0482  hypothetical protein  45.68 
 
 
102 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0449183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2998  hypothetical protein  46.27 
 
 
102 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0207  methyltransferase  47.76 
 
 
99 aa  63.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  37.21 
 
 
122 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1705  Linocin_M18 bacteriocin protein  28.43 
 
 
284 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2360  hypothetical protein  38.1 
 
 
100 aa  60.1  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1933  hypothetical protein  40.85 
 
 
101 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4282  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.42 
 
 
270 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180613  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0098  hypothetical protein  40.48 
 
 
101 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0221803  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_108  hypothetical protein  39.29 
 
 
102 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0270  hypothetical protein  39.29 
 
 
102 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1094  hypothetical protein  39.02 
 
 
124 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2114  hypothetical protein  49.09 
 
 
91 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00651332  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2248  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.55 
 
 
276 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00352886  decreased coverage  0.00701181 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1316  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.23 
 
 
278 aa  47.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600572  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1533  hypothetical protein  41.54 
 
 
107 aa  46.2  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000142155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1284  hypothetical protein  33.71 
 
 
132 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0184871  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0347  hypothetical protein  36.23 
 
 
100 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5123  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.59 
 
 
265 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal  0.576043 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 
282 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1065  hypothetical protein  35.85 
 
 
89 aa  43.1  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  40 
 
 
165 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>