51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1418 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  100 
 
 
352 aa  685    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  95.45 
 
 
358 aa  657    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  52.12 
 
 
373 aa  350  2e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  48.17 
 
 
359 aa  270  2e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.3 
 
 
346 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  55.56 
 
 
96 aa  99  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0417  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.39 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0890  hypothetical protein  61.11 
 
 
94 aa  74.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000110299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  45.83 
 
 
94 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3018  Linocin_M18 bacteriocin protein  30.15 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1010  hypothetical protein  44.32 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1283  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.67 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0692096  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2056  hypothetical protein  38.38 
 
 
123 aa  65.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0119  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.88 
 
 
278 aa  64.7  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000660345  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0884  Rubrerythrin  59.62 
 
 
97 aa  64.3  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00115612  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2055  hypothetical protein  40.22 
 
 
114 aa  63.9  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1061  hypothetical protein  41.67 
 
 
102 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1148  hypothetical protein  40.24 
 
 
104 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1211  hypothetical protein  48.48 
 
 
103 aa  62  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000304169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0817  hypothetical protein  44.59 
 
 
101 aa  61.2  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0627  hypothetical protein  43.9 
 
 
101 aa  59.7  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0482  hypothetical protein  40.48 
 
 
102 aa  59.7  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0449183 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0856  hypothetical protein  44.93 
 
 
102 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.354631  hitchhiker  0.0042327 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2029  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1504  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.25 
 
 
270 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15970  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.23 
 
 
265 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1800  hypothetical protein  42.03 
 
 
102 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463849  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0098  hypothetical protein  40.48 
 
 
101 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0221803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0270  hypothetical protein  44.59 
 
 
102 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_108  hypothetical protein  39.29 
 
 
102 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3017  hypothetical protein  38.14 
 
 
123 aa  56.2  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.85648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1164  hypothetical protein  35.63 
 
 
102 aa  56.2  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4294  hypothetical protein  38.27 
 
 
102 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00503085  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3055  hypothetical protein  40.3 
 
 
112 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0207  methyltransferase  45.31 
 
 
99 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1095  Linocin_M18 bacteriocin protein  31.62 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.236732  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1705  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.19 
 
 
284 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  33.71 
 
 
122 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2827  hypothetical protein  43.08 
 
 
113 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1064  hypothetical protein  40.62 
 
 
77 aa  53.1  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2360  hypothetical protein  35.71 
 
 
100 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2998  hypothetical protein  42.37 
 
 
102 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  33.71 
 
 
119 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1933  hypothetical protein  36.23 
 
 
101 aa  50.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1094  hypothetical protein  35.56 
 
 
124 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2114  hypothetical protein  45.28 
 
 
91 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00651332  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4282  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.91 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180613  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1533  hypothetical protein  40.68 
 
 
107 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000142155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1284  hypothetical protein  34.12 
 
 
132 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0184871  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2440  Rubrerythrin  35.71 
 
 
163 aa  43.1  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  42.59 
 
 
165 aa  42.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>