7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1085 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1085  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  330  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.265267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  25 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  24.36 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  28.03 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  30.72 
 
 
149 aa  44.7  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  28.93 
 
 
165 aa  41.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  28.93 
 
 
165 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>