37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0890 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0890  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000110299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  60.44 
 
 
94 aa  123  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  51.04 
 
 
373 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  54.64 
 
 
359 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2114  hypothetical protein  52.63 
 
 
91 aa  78.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00651332  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1065  hypothetical protein  44.59 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1064  hypothetical protein  55.56 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  48.94 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  50.53 
 
 
358 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  61.11 
 
 
352 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0884  Rubrerythrin  46.84 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00115612  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  37.5 
 
 
346 aa  60.8  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1148  hypothetical protein  42.68 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0627  hypothetical protein  41.11 
 
 
101 aa  56.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2029  hypothetical protein  42.68 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4294  hypothetical protein  37.78 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00503085  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1164  hypothetical protein  35.16 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527792  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1010  hypothetical protein  39.08 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0482  hypothetical protein  38.71 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0449183 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  39.73 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0207  methyltransferase  37.33 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2360  hypothetical protein  35.23 
 
 
100 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797911  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_108  hypothetical protein  42.03 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0270  hypothetical protein  42.03 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0817  hypothetical protein  38.67 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  38.67 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1061  hypothetical protein  40.74 
 
 
102 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0098  hypothetical protein  42.03 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0221803  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1211  hypothetical protein  44.64 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000304169  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1533  hypothetical protein  45.45 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000142155  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3017  hypothetical protein  38.67 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.85648 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2056  hypothetical protein  39.13 
 
 
123 aa  43.5  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  39.34 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2827  hypothetical protein  46.55 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1800  hypothetical protein  34.94 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463849  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2055  hypothetical protein  46.94 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3055  hypothetical protein  35.53 
 
 
112 aa  40.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>