38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1533 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1533  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  217  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000142155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  47.42 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3017  hypothetical protein  44.57 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.85648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  43.82 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1094  hypothetical protein  51.81 
 
 		 124 aa  84.3  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1284  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0184871  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1148  hypothetical protein  40.45 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_108  hypothetical protein  38.04 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0270  hypothetical protein  38.04 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0098  hypothetical protein  38.04 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0221803  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2029  hypothetical protein  35.16 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1061  hypothetical protein  35.87 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0207  methyltransferase  42.68 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1010  hypothetical protein  34.78 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2056  hypothetical protein  38.67 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2360  hypothetical protein  35.48 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4294  hypothetical protein  32.97 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00503085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1211  hypothetical protein  45.07 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000304169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1933  hypothetical protein  41.67 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0817  hypothetical protein  40.24 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2827  hypothetical protein  39.76 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1164  hypothetical protein  33.68 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527792  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1800  hypothetical protein  38.82 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463849  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0856  hypothetical protein  39.02 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.354631  hitchhiker  0.0042327 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2055  hypothetical protein  38.67 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0627  hypothetical protein  36.25 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  35.56 
 
 		 373 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  43.08 
 
 		 359 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.55 
 
 		 346 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3055  hypothetical protein  35.37 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7404  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0890  hypothetical protein  36.62 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000110299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  29.41 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0482  hypothetical protein  33.75 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0449183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2998  hypothetical protein  36.84 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  40 
 
 		 358 aa  45.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  40.68 
 
 		 352 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1797  hypothetical protein  42.59 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>