39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_108 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_108  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  204  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0270  hypothetical protein  98.04 
 
 		 102 aa  201  4e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0098  hypothetical protein  96 
 
 		 101 aa  194  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0221803  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1061  hypothetical protein  78.43 
 
 		 102 aa  167  6e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2360  hypothetical protein  76 
 
 		 100 aa  157  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2029  hypothetical protein  76 
 
 		 103 aa  153  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4294  hypothetical protein  73.27 
 
 		 102 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00503085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1800  hypothetical protein  78.43 
 
 		 102 aa  151  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1933  hypothetical protein  83.53 
 
 		 101 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0856  hypothetical protein  80.23 
 
 		 102 aa  147  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.354631  hitchhiker  0.0042327 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1010  hypothetical protein  70.41 
 
 		 101 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3055  hypothetical protein  76.47 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7404  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0482  hypothetical protein  70.59 
 
 		 102 aa  138  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0449183 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1211  hypothetical protein  77.45 
 
 		 103 aa  137  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000304169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0817  hypothetical protein  76.47 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1164  hypothetical protein  67.02 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2827  hypothetical protein  72.94 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2055  hypothetical protein  64 
 
 		 114 aa  130  7.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0627  hypothetical protein  63.37 
 
 		 101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2056  hypothetical protein  62 
 
 		 123 aa  128  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2998  hypothetical protein  72.5 
 
 		 102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1148  hypothetical protein  63.37 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0207  methyltransferase  67.06 
 
 		 99 aa  113  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1094  hypothetical protein  55.91 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1284  hypothetical protein  54.84 
 
 		 132 aa  94.7  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0184871  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  41.84 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3017  hypothetical protein  40.62 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.85648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  39.13 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  49.33 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  34.69 
 
 		 346 aa  61.6  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  43.04 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1533  hypothetical protein  41.46 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000142155  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  39.29 
 
 		 373 aa  57.8  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  44.59 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  39.29 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  38.27 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0890  hypothetical protein  42.03 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000110299  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0884  Rubrerythrin  43.64 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00115612  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1064  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>