40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1211 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1211  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  201  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000304169  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2029  hypothetical protein  81 
 
 
103 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1061  hypothetical protein  81.37 
 
 
102 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0817  hypothetical protein  90.59 
 
 
101 aa  156  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_108  hypothetical protein  77.45 
 
 
102 aa  155  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1010  hypothetical protein  75.25 
 
 
101 aa  155  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4294  hypothetical protein  74.51 
 
 
102 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00503085  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0270  hypothetical protein  77.45 
 
 
102 aa  154  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0098  hypothetical protein  77 
 
 
101 aa  150  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0221803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2360  hypothetical protein  75 
 
 
100 aa  150  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797911  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2055  hypothetical protein  72 
 
 
114 aa  149  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2056  hypothetical protein  70 
 
 
123 aa  148  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1800  hypothetical protein  79.41 
 
 
102 aa  146  7e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463849  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0482  hypothetical protein  75.49 
 
 
102 aa  145  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0449183 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0627  hypothetical protein  69.31 
 
 
101 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3055  hypothetical protein  80 
 
 
112 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7404  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1164  hypothetical protein  69.15 
 
 
102 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527792  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0856  hypothetical protein  80.39 
 
 
102 aa  141  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.354631  hitchhiker  0.0042327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1933  hypothetical protein  78.22 
 
 
101 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2827  hypothetical protein  76.47 
 
 
113 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1148  hypothetical protein  66 
 
 
104 aa  127  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2998  hypothetical protein  71.25 
 
 
102 aa  120  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0207  methyltransferase  68.24 
 
 
99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1094  hypothetical protein  62.37 
 
 
124 aa  115  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1284  hypothetical protein  56.99 
 
 
132 aa  100  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0184871  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  48.48 
 
 
119 aa  90.1  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3017  hypothetical protein  45.1 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.85648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  47.83 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  55.13 
 
 
96 aa  85.1  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  49.41 
 
 
359 aa  78.2  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  43.96 
 
 
373 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.502019 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  41.84 
 
 
346 aa  70.1  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  45.68 
 
 
358 aa  65.5  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  45.68 
 
 
352 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  47.83 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1533  hypothetical protein  44.44 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000142155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0890  hypothetical protein  46.38 
 
 
94 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000110299  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1064  hypothetical protein  46.67 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0884  Rubrerythrin  45 
 
 
97 aa  50.4  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00115612  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2114  hypothetical protein  37.5 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00651332  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>