39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1164 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1164  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  207  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527792  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2360  hypothetical protein  74 
 
 		 100 aa  154  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4294  hypothetical protein  68.63 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00503085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2029  hypothetical protein  67 
 
 		 103 aa  150  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1061  hypothetical protein  70 
 
 		 102 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2827  hypothetical protein  81.18 
 
 		 113 aa  149  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0482  hypothetical protein  68.63 
 
 		 102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0449183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1933  hypothetical protein  76.74 
 
 		 101 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1800  hypothetical protein  73.03 
 
 		 102 aa  140  8e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463849  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0627  hypothetical protein  62.38 
 
 		 101 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0856  hypothetical protein  74.12 
 
 		 102 aa  137  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.354631  hitchhiker  0.0042327 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3055  hypothetical protein  74.12 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7404  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_108  hypothetical protein  67.02 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1010  hypothetical protein  63.44 
 
 		 101 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0270  hypothetical protein  67.02 
 
 		 102 aa  134  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0098  hypothetical protein  65.96 
 
 		 101 aa  133  8e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0221803  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1211  hypothetical protein  69.41 
 
 		 103 aa  130  6.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000304169  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2055  hypothetical protein  55.88 
 
 		 114 aa  124  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2056  hypothetical protein  54.9 
 
 		 123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0817  hypothetical protein  65.88 
 
 		 101 aa  124  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1148  hypothetical protein  54.9 
 
 		 104 aa  121  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2998  hypothetical protein  68.75 
 
 		 102 aa  120  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1094  hypothetical protein  56.84 
 
 		 124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0207  methyltransferase  56.47 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1284  hypothetical protein  53.06 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0184871  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3017  hypothetical protein  42.42 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.85648 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  50.62 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  41 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  38.38 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  48.15 
 
 		 359 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  37.93 
 
 		 373 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.502019 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  35.48 
 
 		 346 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  35.63 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  35.63 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  40.22 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0890  hypothetical protein  35.16 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000110299  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1533  hypothetical protein  35.71 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000142155  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1064  hypothetical protein  41.27 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0884  Rubrerythrin  38.18 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00115612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>