38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2360 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2360  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  202  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797911  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1061  hypothetical protein  81 
 
 
102 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4294  hypothetical protein  78 
 
 
102 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00503085  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2029  hypothetical protein  77 
 
 
103 aa  158  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_108  hypothetical protein  76 
 
 
102 aa  157  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1933  hypothetical protein  83 
 
 
101 aa  157  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0270  hypothetical protein  76 
 
 
102 aa  157  6e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0098  hypothetical protein  76 
 
 
101 aa  156  8e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0221803  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1800  hypothetical protein  81 
 
 
102 aa  156  8e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1164  hypothetical protein  74 
 
 
102 aa  154  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527792  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1010  hypothetical protein  70 
 
 
101 aa  151  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0856  hypothetical protein  82.56 
 
 
102 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.354631  hitchhiker  0.0042327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0482  hypothetical protein  76.24 
 
 
102 aa  149  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0449183 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3055  hypothetical protein  82.35 
 
 
112 aa  149  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2827  hypothetical protein  80 
 
 
113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0627  hypothetical protein  64 
 
 
101 aa  135  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0817  hypothetical protein  74.75 
 
 
101 aa  135  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1211  hypothetical protein  75 
 
 
103 aa  133  8e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000304169  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2056  hypothetical protein  63 
 
 
123 aa  130  9e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2055  hypothetical protein  64 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2998  hypothetical protein  73.75 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1148  hypothetical protein  61 
 
 
104 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1094  hypothetical protein  58.06 
 
 
124 aa  106  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0207  methyltransferase  61.18 
 
 
99 aa  106  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1284  hypothetical protein  56.99 
 
 
132 aa  97.4  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0184871  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  45.45 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  43 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3017  hypothetical protein  41.41 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.85648 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  51.28 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  36.08 
 
 
346 aa  64.7  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  42.35 
 
 
359 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  38.1 
 
 
373 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  35.71 
 
 
352 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1533  hypothetical protein  38.55 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000142155  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  35.71 
 
 
358 aa  52  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  42.11 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0890  hypothetical protein  35.23 
 
 
94 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000110299  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0884  Rubrerythrin  38.18 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00115612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>