40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2827 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2827  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  225  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1061  hypothetical protein  81.37 
 
 
102 aa  168  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4294  hypothetical protein  81.19 
 
 
102 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00503085  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1164  hypothetical protein  74.26 
 
 
102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527792  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2360  hypothetical protein  77.23 
 
 
100 aa  159  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2029  hypothetical protein  77 
 
 
103 aa  156  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1800  hypothetical protein  82.02 
 
 
102 aa  150  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463849  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0270  hypothetical protein  71.57 
 
 
102 aa  149  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_108  hypothetical protein  70.59 
 
 
102 aa  147  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0856  hypothetical protein  82.56 
 
 
102 aa  147  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.354631  hitchhiker  0.0042327 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3055  hypothetical protein  82.35 
 
 
112 aa  147  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7404  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1010  hypothetical protein  75.27 
 
 
101 aa  146  9e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0098  hypothetical protein  71.29 
 
 
101 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0221803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0482  hypothetical protein  72.55 
 
 
102 aa  144  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0449183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1933  hypothetical protein  80 
 
 
101 aa  142  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0627  hypothetical protein  70.3 
 
 
101 aa  140  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1211  hypothetical protein  76.47 
 
 
103 aa  135  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000304169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2998  hypothetical protein  78.75 
 
 
102 aa  133  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0817  hypothetical protein  74.12 
 
 
101 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2055  hypothetical protein  59.29 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2056  hypothetical protein  64 
 
 
123 aa  127  6e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1148  hypothetical protein  59.62 
 
 
104 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0207  methyltransferase  62.35 
 
 
99 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1094  hypothetical protein  57.89 
 
 
124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1284  hypothetical protein  54.17 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0184871  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  44.25 
 
 
119 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3017  hypothetical protein  52.04 
 
 
123 aa  90.1  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.85648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  43.52 
 
 
122 aa  88.6  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  47.83 
 
 
96 aa  80.1  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  41.24 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  42.86 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  47.5 
 
 
359 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  41.98 
 
 
352 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  41.98 
 
 
358 aa  57.4  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1533  hypothetical protein  39.76 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000142155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  42.25 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0890  hypothetical protein  44.44 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000110299  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0884  Rubrerythrin  45.45 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00115612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2323  hypothetical protein  34.33 
 
 
174 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2637  hypothetical protein  34.33 
 
 
174 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>