37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1284 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1284  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  263  8e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0184871  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1094  hypothetical protein  54.2 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2029  hypothetical protein  54.74 
 
 
103 aa  100  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1061  hypothetical protein  55.91 
 
 
102 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1164  hypothetical protein  53.06 
 
 
102 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527792  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  52.63 
 
 
119 aa  99  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2360  hypothetical protein  56.99 
 
 
100 aa  97.4  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797911  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1800  hypothetical protein  56.18 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_108  hypothetical protein  54.84 
 
 
102 aa  94.7  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  48.42 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4294  hypothetical protein  53.68 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00503085  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1211  hypothetical protein  58.33 
 
 
103 aa  94  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000304169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0817  hypothetical protein  57.14 
 
 
101 aa  94  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1010  hypothetical protein  53.19 
 
 
101 aa  94  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0270  hypothetical protein  54.84 
 
 
102 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2055  hypothetical protein  46.43 
 
 
114 aa  92.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0856  hypothetical protein  55.81 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.354631  hitchhiker  0.0042327 
 
 
-
 
NC_002936  DET0098  hypothetical protein  53.76 
 
 
101 aa  92  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0221803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2998  hypothetical protein  56.25 
 
 
102 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1148  hypothetical protein  47.37 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1933  hypothetical protein  57.14 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0482  hypothetical protein  52.08 
 
 
102 aa  87.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0449183 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2056  hypothetical protein  42.86 
 
 
123 aa  87.4  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3017  hypothetical protein  50 
 
 
123 aa  87  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.85648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3055  hypothetical protein  54.76 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2827  hypothetical protein  54.76 
 
 
113 aa  84.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0207  methyltransferase  53.57 
 
 
99 aa  84  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0627  hypothetical protein  45.26 
 
 
101 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1533  hypothetical protein  50.63 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000142155  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  45 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  40.91 
 
 
359 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  30.49 
 
 
346 aa  47  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1064  hypothetical protein  45.31 
 
 
77 aa  47  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  33.71 
 
 
373 aa  47  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  31.37 
 
 
358 aa  45.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  34.12 
 
 
352 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  33.33 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>