43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1148 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1148  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  207  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0627  hypothetical protein  64.36 
 
 
101 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2029  hypothetical protein  65 
 
 
103 aa  131  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1061  hypothetical protein  65 
 
 
102 aa  126  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4294  hypothetical protein  60.78 
 
 
102 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00503085  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2360  hypothetical protein  61 
 
 
100 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0482  hypothetical protein  64.71 
 
 
102 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0449183 
 
 
-
 
NC_002936  DET0098  hypothetical protein  64.36 
 
 
101 aa  121  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0221803  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2056  hypothetical protein  59 
 
 
123 aa  121  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2055  hypothetical protein  61 
 
 
114 aa  121  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1164  hypothetical protein  54.9 
 
 
102 aa  121  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527792  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_108  hypothetical protein  63.37 
 
 
102 aa  120  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0270  hypothetical protein  63.37 
 
 
102 aa  119  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1800  hypothetical protein  65.91 
 
 
102 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463849  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1211  hypothetical protein  66 
 
 
103 aa  117  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000304169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0817  hypothetical protein  65.88 
 
 
101 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1010  hypothetical protein  58 
 
 
101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0856  hypothetical protein  65.88 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.354631  hitchhiker  0.0042327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1933  hypothetical protein  68.24 
 
 
101 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3055  hypothetical protein  63.53 
 
 
112 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2998  hypothetical protein  63.29 
 
 
102 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2827  hypothetical protein  61.18 
 
 
113 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0207  methyltransferase  61.18 
 
 
99 aa  106  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  51 
 
 
119 aa  99  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1094  hypothetical protein  51.58 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3017  hypothetical protein  46.46 
 
 
123 aa  94  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.85648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  44.95 
 
 
122 aa  90.5  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1284  hypothetical protein  47.37 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0184871  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  48.15 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  42.55 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  43.9 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  40 
 
 
359 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  37.76 
 
 
358 aa  64.3  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  40.24 
 
 
352 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1533  hypothetical protein  42.17 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000142155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0890  hypothetical protein  42.68 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000110299  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0884  Rubrerythrin  48.21 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00115612  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  35.37 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2323  hypothetical protein  33.75 
 
 
174 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2637  hypothetical protein  32.5 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1064  hypothetical protein  45.16 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3831  hypothetical protein  29.85 
 
 
96 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2465  hypothetical protein  35.85 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.705928  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>