14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2637 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2637  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  345  3e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2323  hypothetical protein  97.13 
 
 
174 aa  338  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1797  hypothetical protein  40.68 
 
 
170 aa  107  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1782  rubrerythrin family protein  37.65 
 
 
184 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2055  hypothetical protein  42.25 
 
 
114 aa  49.3  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1010  hypothetical protein  41.79 
 
 
101 aa  48.9  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  42.42 
 
 
119 aa  48.5  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2056  hypothetical protein  40.85 
 
 
123 aa  48.1  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  38.24 
 
 
122 aa  47.4  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3055  hypothetical protein  36.76 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7404  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3017  hypothetical protein  39.68 
 
 
123 aa  45.1  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.85648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1148  hypothetical protein  32.5 
 
 
104 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1933  hypothetical protein  31.58 
 
 
101 aa  42  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2827  hypothetical protein  34.33 
 
 
113 aa  41.2  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>