15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2323 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2323  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  344  4e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2637  hypothetical protein  97.13 
 
 
174 aa  338  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1782  rubrerythrin family protein  37.71 
 
 
184 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1797  hypothetical protein  38.98 
 
 
170 aa  104  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2055  hypothetical protein  42.25 
 
 
114 aa  48.9  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1010  hypothetical protein  41.79 
 
 
101 aa  48.9  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  42.42 
 
 
119 aa  48.9  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2056  hypothetical protein  40.85 
 
 
123 aa  47.8  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  38.81 
 
 
122 aa  47.8  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3055  hypothetical protein  37.31 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7404  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3017  hypothetical protein  39.68 
 
 
123 aa  45.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.85648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1148  hypothetical protein  33.75 
 
 
104 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1933  hypothetical protein  32 
 
 
101 aa  42  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2827  hypothetical protein  34.33 
 
 
113 aa  40.8  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0837  hypothetical protein  32.91 
 
 
101 aa  40.8  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.05984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>