44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1503 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  241  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  74.79 
 
 		 122 aa  175  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3017  hypothetical protein  71 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.85648 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1094  hypothetical protein  50.42 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1284  hypothetical protein  52.63 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0184871  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1148  hypothetical protein  51 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0627  hypothetical protein  51 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1061  hypothetical protein  49 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2029  hypothetical protein  47 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1533  hypothetical protein  51.19 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000142155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4294  hypothetical protein  44.44 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00503085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  48.91 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0207  methyltransferase  51.76 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1010  hypothetical protein  47.31 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2360  hypothetical protein  43 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1164  hypothetical protein  41 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527792  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1211  hypothetical protein  49.41 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000304169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0817  hypothetical protein  48.24 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2998  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1800  hypothetical protein  47.73 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463849  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2056  hypothetical protein  41.18 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0856  hypothetical protein  47.67 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.354631  hitchhiker  0.0042327 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_108  hypothetical protein  41.84 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2827  hypothetical protein  47.06 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0270  hypothetical protein  41.84 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2055  hypothetical protein  41.18 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0482  hypothetical protein  41.58 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0449183 
 
 
-
 
NC_002936  DET0098  hypothetical protein  41.84 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0221803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3055  hypothetical protein  45.88 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1933  hypothetical protein  45.88 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  47.5 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  39.36 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.502019 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  36.56 
 
 		 346 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  34.57 
 
 		 358 aa  51.2  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  33.71 
 
 		 352 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0890  hypothetical protein  39.73 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000110299  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2323  hypothetical protein  42.42 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2637  hypothetical protein  42.42 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0973  hypothetical protein  37.8 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0086355  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  33.33 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1064  hypothetical protein  38.71 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2247  hypothetical protein  48.94 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  decreased coverage  0.00677011 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0884  Rubrerythrin  41.89 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00115612  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34640  hypothetical protein  34.48 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>