40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0482 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0482  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  198  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0449183 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2029  hypothetical protein  77.23 
 
 
103 aa  153  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2360  hypothetical protein  76.24 
 
 
100 aa  149  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797911  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1061  hypothetical protein  76.24 
 
 
102 aa  148  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1164  hypothetical protein  68.63 
 
 
102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527792  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0098  hypothetical protein  73.53 
 
 
101 aa  141  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0221803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4294  hypothetical protein  70.59 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00503085  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1010  hypothetical protein  69.31 
 
 
101 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_108  hypothetical protein  70.59 
 
 
102 aa  138  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0270  hypothetical protein  70.59 
 
 
102 aa  137  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1800  hypothetical protein  74.26 
 
 
102 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463849  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0627  hypothetical protein  65.69 
 
 
101 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1211  hypothetical protein  80.23 
 
 
103 aa  132  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000304169  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2055  hypothetical protein  67.33 
 
 
114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2056  hypothetical protein  65.35 
 
 
123 aa  131  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0856  hypothetical protein  76.74 
 
 
102 aa  130  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.354631  hitchhiker  0.0042327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1933  hypothetical protein  76.74 
 
 
101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2827  hypothetical protein  74.42 
 
 
113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3055  hypothetical protein  72.09 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7404  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0817  hypothetical protein  71 
 
 
101 aa  123  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1148  hypothetical protein  64.71 
 
 
104 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2998  hypothetical protein  67.9 
 
 
102 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0207  methyltransferase  63.95 
 
 
99 aa  102  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1094  hypothetical protein  57.29 
 
 
124 aa  98.6  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1284  hypothetical protein  52.08 
 
 
132 aa  87.4  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0184871  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  42 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  45.98 
 
 
346 aa  77  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  41.58 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  49.38 
 
 
96 aa  73.6  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3017  hypothetical protein  40 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.85648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  50 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  45.68 
 
 
373 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  40.48 
 
 
352 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  40.48 
 
 
358 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0890  hypothetical protein  38.71 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000110299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  32.22 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1533  hypothetical protein  36.62 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000142155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2637  hypothetical protein  33.8 
 
 
174 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0884  Rubrerythrin  40 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00115612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2323  hypothetical protein  33.8 
 
 
174 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>