More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0648 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0648  amidohydrolase  100 
 
 		 393 aa  779    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132574  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  48.52 
 
 		 387 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  47.98 
 
 		 387 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  51.48 
 
 		 388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  50.4 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  49.06 
 
 		 389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  49.73 
 
 		 390 aa  342  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  48.15 
 
 		 387 aa  342  5.999999999999999e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  45.45 
 
 		 389 aa  342  9e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  50.39 
 
 		 394 aa  342  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  50.53 
 
 		 389 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  52.01 
 
 		 388 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  51.72 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  46.34 
 
 		 397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  47.62 
 
 		 406 aa  338  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 		 389 aa  338  8e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  51.47 
 
 		 388 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  48.26 
 
 		 387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  52.01 
 
 		 390 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  47.99 
 
 		 387 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  45.18 
 
 		 395 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  47.21 
 
 		 395 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  47.72 
 
 		 387 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  48.28 
 
 		 387 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  45.18 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  48.53 
 
 		 405 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  47.95 
 
 		 392 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  45.43 
 
 		 401 aa  333  4e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  49.06 
 
 		 388 aa  332  5e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  45.81 
 
 		 396 aa  332  8e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  44.97 
 
 		 388 aa  332  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  43.96 
 
 		 404 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  45.17 
 
 		 401 aa  332  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  50.53 
 
 		 389 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  49.33 
 
 		 384 aa  330  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  45.55 
 
 		 396 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  45.55 
 
 		 403 aa  329  6e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  44.91 
 
 		 398 aa  329  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  44.62 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  49.33 
 
 		 390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  50.93 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 		 390 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7452  peptidase M20D, amidohydrolase  46.11 
 
 		 416 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  46.84 
 
 		 394 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  43.72 
 
 		 397 aa  325  6e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  46.58 
 
 		 394 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  45.29 
 
 		 396 aa  325  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  45.43 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  43.7 
 
 		 396 aa  323  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  45.43 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  46.75 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  45.03 
 
 		 396 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  43.9 
 
 		 401 aa  323  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  45.43 
 
 		 395 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  47.43 
 
 		 389 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  50 
 
 		 388 aa  322  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  47.03 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  43.6 
 
 		 423 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  46.83 
 
 		 391 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  46.13 
 
 		 394 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  44.65 
 
 		 397 aa  319  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  45.31 
 
 		 390 aa  319  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  45.87 
 
 		 394 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  45.87 
 
 		 394 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  45.87 
 
 		 394 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  46.4 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  46.56 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  51.19 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  45.03 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  45.03 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  44.77 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  46.38 
 
 		 384 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  46.48 
 
 		 402 aa  316  5e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  48.66 
 
 		 387 aa  316  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  45.11 
 
 		 389 aa  316  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4917  amidohydrolase family protein  43.78 
 
 		 376 aa  315  6e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.863248  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  46.98 
 
 		 390 aa  315  9e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  47.3 
 
 		 385 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  45.33 
 
 		 396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  45.33 
 
 		 396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  46.79 
 
 		 390 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  45.33 
 
 		 396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  44.76 
 
 		 394 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  42.47 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  42.37 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  45.33 
 
 		 396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  45.33 
 
 		 396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  48.27 
 
 		 391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  48.63 
 
 		 395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  45.33 
 
 		 396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  45.33 
 
 		 396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  45.95 
 
 		 393 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  48.48 
 
 		 395 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  44.77 
 
 		 387 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  45.07 
 
 		 396 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  43.82 
 
 		 379 aa  312  7.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  47.61 
 
 		 385 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4779  amidohydrolase  48.1 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.0993236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  43.56 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  42.33 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>