More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6427 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6427  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.92 
 
 		 221 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 215 aa  202  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3475  response regulator receiver  50.45 
 
 		 228 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5522  two component LuxR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 222 aa  191  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  48 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  46.7 
 
 		 213 aa  181  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0199  response regulator receiver protein  48.13 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  48.17 
 
 		 218 aa  177  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  42.92 
 
 		 220 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.7 
 
 		 213 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  44.55 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.85 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  44.7 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.55 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  47.91 
 
 		 215 aa  174  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.53 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  47.53 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.45 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  45.07 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.26 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5499  response regulator receiver protein  46.33 
 
 		 213 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00659712  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.18 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  45.62 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.18 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.85 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.35 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.16 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.04 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.09 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.54 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.36 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.26 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 222 aa  167  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  44.24 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.33 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.21 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.69 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.66 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.32 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.27 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.74 
 
 		 230 aa  165  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 228 aa  164  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 227 aa  164  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.66 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.91 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  46 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5656  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.18 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2391  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.8 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0696687  hitchhiker  0.00128542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.53 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.61 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2518  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.98 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.6 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04500  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.53 
 
 		 244 aa  161  7e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08490  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.91 
 
 		 236 aa  161  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199706  normal  0.526513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  44.6 
 
 		 213 aa  161  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 242 aa  161  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.18 
 
 		 211 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1652  two component LuxR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 217 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2010  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 214 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  45.33 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.34 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.7 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.46 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1350  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.41 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0608  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.52 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.35 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.41 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4219  response regulator receiver protein  49.77 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  hitchhiker  0.000784643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  43.4 
 
 		 218 aa  159  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2730  response regulator receiver  44.81 
 
 		 216 aa  159  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.776601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  43.78 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  44.7 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3714  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  41.96 
 
 		 230 aa  158  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  41.7 
 
 		 217 aa  158  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.99 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0671  putative response regulator  36.93 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.248332  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.29 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0644  response regulator receiver domain protein  34.92 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.520039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  40.72 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2190  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.26 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000643495  hitchhiker  0.000215707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>