More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4041 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4041  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3223  ABC transporter related  45.75 
 
 		 573 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  42.44 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  45.9 
 
 		 940 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  42.6 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  44.8 
 
 		 246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  41.07 
 
 		 238 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  39.09 
 
 		 234 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  40.62 
 
 		 242 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3396  ABC transporter related  44.55 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  43.3 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  43.89 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  44.34 
 
 		 237 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  44.49 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  44.49 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  42.86 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  43.5 
 
 		 240 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  43.64 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  42.27 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  45.62 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  43.64 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  38.18 
 
 		 234 aa  178  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  40.44 
 
 		 256 aa  178  8e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.55 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  42.86 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  41.96 
 
 		 240 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3869  ABC transporter related  44.95 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166635  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  41.96 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  42.79 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  42.41 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  41.63 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  38.46 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.29 
 
 		 233 aa  176  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  44.55 
 
 		 238 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  44.29 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  38.18 
 
 		 260 aa  175  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  38.18 
 
 		 235 aa  174  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  43.64 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.72 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  43.84 
 
 		 236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  40.72 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  43.18 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  40.27 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0145  ABC transporter related  41.38 
 
 		 243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  42.01 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  43.12 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2953  ABC transporter related  44.09 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.181983  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  37.56 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  40.89 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  37.27 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.67 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.42 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  39.73 
 
 		 232 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  41.44 
 
 		 247 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2137  ABC transporter related protein  45.37 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0427504 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  41.44 
 
 		 247 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  42.27 
 
 		 234 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 235 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 		 238 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.38 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  37.39 
 
 		 237 aa  171  7.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4915  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.38 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3249  ABC transporter related  39.92 
 
 		 749 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  46.92 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  41.18 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.38 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0310  ABC transporter related  37.23 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327886  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4015  ABC transporter related  44.59 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  39.37 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  41.44 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4919  ABC transporter related  40.27 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000800081  decreased coverage  0.0000000000000903598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  41.23 
 
 		 244 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.67 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  36.82 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  42.67 
 
 		 694 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.67 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.67 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  44.55 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  37.73 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.67 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5634  ABC transporter ATP-binding protein  41.7 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.67 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3153  ABC transporter related  40.99 
 
 		 803 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.41 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  39.82 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  37.67 
 
 		 239 aa  169  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  41.13 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  37.73 
 
 		 239 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26090  ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  41.33 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  38.29 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3191  ABC transporter related  40.54 
 
 		 748 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  40.77 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3498  ABC transporter related  42.08 
 
 		 236 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>