More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1284 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1284  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132719  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  74.78 
 
 		 1302 aa  293  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5561  ABC transporter related  52.3 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4484  ABC transporter related  55.16 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2137  ABC transporter related protein  50.88 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0427504 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  48.88 
 
 		 235 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4565  ABC transporter related  50.22 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.683769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5861  ABC transporter related  43.33 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  47.58 
 
 		 823 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1176  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128405  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  47.15 
 
 		 827 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0215  ABC transporter related  47.03 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.871033  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  42.74 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  47.11 
 
 		 822 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2953  ABC transporter related  46.52 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.181983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2540  ABC transporter-like protein  48.21 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  47.18 
 
 		 823 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  42.17 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  41.28 
 
 		 238 aa  165  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1908  ABC transporter related  44.92 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  44.78 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  45.22 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  45.22 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  47.58 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  41.88 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.74 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  39.15 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2638  ABC transporter related protein  45.57 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.545525  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  40.17 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  39.68 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  40.17 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0614  ABC transporter related  39.21 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  39.74 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  40.17 
 
 		 238 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  44.89 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  41.91 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  39.74 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  39.74 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  41.45 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.74 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  44.21 
 
 		 828 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  46.32 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.74 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  39.74 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.74 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.74 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  42.31 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.74 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  42.06 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0055  ABC transporter related  42.67 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  41.53 
 
 		 238 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  41.53 
 
 		 238 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  41.42 
 
 		 249 aa  158  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  42.48 
 
 		 235 aa  158  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  48.31 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2267  ABC transporter related  43.04 
 
 		 238 aa  158  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  42.17 
 
 		 238 aa  158  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.88 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7510  branched-chain amino acid transport ATP-binding protein LivF  43.23 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  43.78 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  44.54 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  41.28 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  39.75 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  42.98 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.56 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0335  ABC transporter related  43.15 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  40.91 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  42.74 
 
 		 832 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  45.92 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  40.79 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4451  ABC transporter related  44.09 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0769316  normal  0.0804857 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  39.3 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3858  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  43.69 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  38.89 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  42.15 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  43.67 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.79 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1980  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component-like protein  46.61 
 
 		 898 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  43.67 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  44.02 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0475  ABC transporter related  43.59 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  39.92 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2888  high-affinity branched-chain amino acid transport protein (ABC transporter ATP-binding protein)  38.56 
 
 		 234 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.0641084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  43.4 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  42.98 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2552  ABC transporter-related protein  42.13 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  41.7 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  39.82 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  41.7 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  43.59 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  44.44 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  45.09 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  45.21 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>