More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1337 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1337  ammonium transporter  100 
 
 		 460 aa  929    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06675  ammonium transporter  54.13 
 
 		 427 aa  450  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2140  ammonium transporter  57.11 
 
 		 438 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  56.32 
 
 		 462 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  53.3 
 
 		 453 aa  398  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3314  ammonium transporter  53.85 
 
 		 442 aa  395  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0443  ammonium transporter  54.95 
 
 		 439 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1347  ammonium transporter  52.95 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  45 
 
 		 467 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  44.1 
 
 		 427 aa  323  6e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  45.85 
 
 		 405 aa  323  6e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  45.99 
 
 		 405 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  44.94 
 
 		 461 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  43.73 
 
 		 449 aa  316  7e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  44.5 
 
 		 466 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  44.5 
 
 		 466 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  44.5 
 
 		 500 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  44.5 
 
 		 466 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  44.5 
 
 		 500 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  44.5 
 
 		 444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  44.5 
 
 		 478 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  43.13 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  44.91 
 
 		 397 aa  312  9e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  44.26 
 
 		 469 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  43.58 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  43.73 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  42.4 
 
 		 406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  44.98 
 
 		 504 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  44.58 
 
 		 431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  44.74 
 
 		 500 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  44.74 
 
 		 500 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  44.74 
 
 		 500 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04231  hypothetical protein  43.68 
 
 		 449 aa  306  7e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  42.86 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  44.5 
 
 		 500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  42.86 
 
 		 410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  43.96 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  42.61 
 
 		 410 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  43.73 
 
 		 411 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  42.86 
 
 		 410 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  42.86 
 
 		 410 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  42.61 
 
 		 410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  46.91 
 
 		 470 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  43.91 
 
 		 488 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  42.86 
 
 		 410 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  42.51 
 
 		 410 aa  300  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  40.27 
 
 		 451 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  45.23 
 
 		 408 aa  300  5e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  45.1 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  44.99 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  43.33 
 
 		 499 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  43.69 
 
 		 431 aa  297  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  43.41 
 
 		 454 aa  296  4e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  42.14 
 
 		 501 aa  296  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  42.14 
 
 		 434 aa  296  7e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  44.28 
 
 		 411 aa  296  8e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  44.33 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  42.86 
 
 		 502 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  43.1 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  43.55 
 
 		 453 aa  294  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  41 
 
 		 438 aa  294  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  41 
 
 		 438 aa  294  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  41.97 
 
 		 463 aa  293  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  41.44 
 
 		 472 aa  293  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  43.81 
 
 		 402 aa  292  7e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  42.75 
 
 		 515 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  42.86 
 
 		 485 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  42 
 
 		 515 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  44.74 
 
 		 497 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  40.69 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  44.74 
 
 		 503 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  41.35 
 
 		 474 aa  289  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  41.39 
 
 		 436 aa  289  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  42.16 
 
 		 462 aa  289  7e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0776  ammonia permease  42.68 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  41.67 
 
 		 489 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  44.1 
 
 		 413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2232  ammonium transporter  42.51 
 
 		 394 aa  286  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0749  ammonium transporter  42.26 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000261873  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1491  ammonium transporter  43 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.936264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2342  ammonium transporter  41.72 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.602093 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  42.04 
 
 		 459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  42.21 
 
 		 496 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  39.56 
 
 		 433 aa  282  9e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  42.2 
 
 		 455 aa  282  9e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  42.65 
 
 		 466 aa  282  9e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  42.69 
 
 		 470 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  40.96 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  42.24 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  40.77 
 
 		 466 aa  281  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  42.45 
 
 		 507 aa  280  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  40.88 
 
 		 461 aa  280  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  41.61 
 
 		 466 aa  280  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  40.69 
 
 		 434 aa  279  6e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2464  ammonium transporter  42.51 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2376  ammonium transporter  42.75 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  42.75 
 
 		 464 aa  277  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  44.96 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  42.03 
 
 		 443 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  42.86 
 
 		 411 aa  276  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>