More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0443 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1347  ammonium transporter  80.77 
 
 		 442 aa  660    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0443  ammonium transporter  100 
 
 		 439 aa  867    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  63.43 
 
 		 453 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3314  ammonium transporter  67.38 
 
 		 442 aa  523  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  62.3 
 
 		 462 aa  519  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2140  ammonium transporter  59.58 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06675  ammonium transporter  58.26 
 
 		 427 aa  475  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1337  ammonium transporter  54.95 
 
 		 460 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  50.36 
 
 		 467 aa  360  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  48.39 
 
 		 406 aa  355  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  47.77 
 
 		 449 aa  349  5e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  46.35 
 
 		 488 aa  348  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  47.64 
 
 		 489 aa  345  7e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  47.75 
 
 		 485 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  45.23 
 
 		 411 aa  342  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  47.58 
 
 		 451 aa  342  8e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  44.99 
 
 		 410 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  44.74 
 
 		 410 aa  339  5e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  45.48 
 
 		 410 aa  339  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  45.28 
 
 		 515 aa  339  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  44.99 
 
 		 410 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  47.22 
 
 		 457 aa  338  8e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  44.99 
 
 		 410 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  44.5 
 
 		 410 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  44.99 
 
 		 410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  45.19 
 
 		 410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  44.81 
 
 		 515 aa  336  5e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  46.06 
 
 		 431 aa  333  4e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  50.5 
 
 		 408 aa  333  4e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  50.5 
 
 		 408 aa  332  1e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  48.01 
 
 		 402 aa  331  1e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  50.25 
 
 		 408 aa  330  3e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  46.12 
 
 		 405 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  46.91 
 
 		 434 aa  328  8e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  40.45 
 
 		 405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  46.6 
 
 		 496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  46.53 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  46.01 
 
 		 461 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  47.13 
 
 		 397 aa  326  6e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  44.69 
 
 		 462 aa  326  6e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  45.48 
 
 		 507 aa  325  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  48.28 
 
 		 470 aa  323  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  46.52 
 
 		 427 aa  323  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  47.01 
 
 		 400 aa  319  5e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  46.52 
 
 		 398 aa  318  9e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  46.36 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  47.17 
 
 		 405 aa  317  3e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  45.45 
 
 		 429 aa  316  6e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  43.9 
 
 		 470 aa  315  9e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  45 
 
 		 472 aa  315  9e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  45.41 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  44.12 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1679  ammonia permease  42.93 
 
 		 448 aa  313  3.9999999999999997e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  47.06 
 
 		 464 aa  312  7.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  44.23 
 
 		 432 aa  312  7.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  41.73 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  48.76 
 
 		 411 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  46.02 
 
 		 397 aa  310  5e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1270  ammonium transporter  47.95 
 
 		 461 aa  309  6.999999999999999e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  44.28 
 
 		 431 aa  309  8e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  43.84 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  44.85 
 
 		 444 aa  307  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  43.84 
 
 		 434 aa  307  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  44.76 
 
 		 431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2342  ammonium transporter  47.3 
 
 		 455 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.602093 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  43.57 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  44.85 
 
 		 455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  44.53 
 
 		 432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0749  ammonium transporter  41.73 
 
 		 405 aa  302  8.000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000261873  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  43.3 
 
 		 478 aa  302  9e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  43.06 
 
 		 456 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0089  ammonium transporter  43.56 
 
 		 443 aa  301  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  46.81 
 
 		 423 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  43.82 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0566  ammonium transporter  43.03 
 
 		 427 aa  300  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0404362  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  43.06 
 
 		 501 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0086  ammonium transporter  44.44 
 
 		 444 aa  300  4e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  44.72 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04231  hypothetical protein  44.12 
 
 		 449 aa  299  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  44.58 
 
 		 500 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  44.58 
 
 		 500 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  44.58 
 
 		 466 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  44.58 
 
 		 466 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  44.58 
 
 		 466 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  44.55 
 
 		 504 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  46.19 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  44.58 
 
 		 444 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  44.58 
 
 		 478 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  43.5 
 
 		 469 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  44.21 
 
 		 499 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  42.79 
 
 		 438 aa  297  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  42.79 
 
 		 438 aa  297  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  42.22 
 
 		 411 aa  296  5e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  44.68 
 
 		 502 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  42.72 
 
 		 500 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  42.72 
 
 		 500 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  42.72 
 
 		 500 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  42.54 
 
 		 399 aa  294  3e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  46.52 
 
 		 401 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2464  ammonium transporter  47.45 
 
 		 456 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>