More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1164 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1164  putative DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 317 aa  649    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.898654  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0750  putative DNA-binding transcriptional regulator  70.35 
 
 		 317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.261288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0736  putative DNA-binding transcriptional regulator  70.35 
 
 		 317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0676  putative DNA-binding transcriptional regulator  70.35 
 
 		 317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000759051  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0794  putative DNA-binding transcriptional regulator  70.35 
 
 		 317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0690  putative DNA-binding transcriptional regulator  70.35 
 
 		 317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.869609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0649  putative DNA-binding transcriptional regulator  64.35 
 
 		 317 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00471226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0717  putative DNA-binding transcriptional regulator  64.67 
 
 		 317 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000430698  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00598  predicted DNA-binding transcriptional regulator  63.72 
 
 		 317 aa  424  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133775  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2997  transcriptional regulator, LysR family  63.72 
 
 		 317 aa  425  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3016  putative DNA-binding transcriptional regulator  63.72 
 
 		 317 aa  425  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00587  hypothetical protein  63.72 
 
 		 317 aa  424  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0654  putative DNA-binding transcriptional regulator  63.72 
 
 		 317 aa  425  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000955262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0681  putative DNA-binding transcriptional regulator  63.72 
 
 		 317 aa  425  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0624  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0624  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3021  transcriptional regulator, LysR family  31.77 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0655  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3040  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0689  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.555049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0645  transcriptional regulator, LysR family  32.04 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0718  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0703  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0636241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0764  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0275467  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0659  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0310  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1974  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0794  transcriptional regulator, LysR family protein  27.76 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  25.98 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  25.98 
 
 		 314 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2206  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3412  regulatory protein, LysR  27.38 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.366877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0081  leucine transcriptional activator  26.46 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 305 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00078  leucine transcriptional activator  26.46 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3523  transcriptional regulator, LysR family  26.46 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3581  leucine transcriptional activator  26.46 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.000946626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0081  leucine transcriptional activator  26.46 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.669516  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0078  leucine transcriptional activator  26.46 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00077  hypothetical protein  26.46 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0746  leucine transcriptional activator  25.77 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0084  leucine transcriptional activator  26.46 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2018  transcription regulator protein  31.77 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.416664  normal  0.213867 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3789  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2331  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 307 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0131  leucine transcriptional activator  27.76 
 
 		 314 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0678941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0131  leucine transcriptional activator  27.36 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0127  leucine transcriptional activator  27.76 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0126  leucine transcriptional activator  27.76 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  hitchhiker  0.00376656 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0069  leucine transcriptional activator  27.06 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001651  transcriptional regulator LysR family  27.05 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002655  LysR-like transcriptional regulator  28.46 
 
 		 306 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3957  LysR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 322 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4563  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3800  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3724  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0124  leucine transcriptional activator  27.42 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.442889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  24.75 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  23.43 
 
 		 310 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1282  LysR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.526163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4567  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.227329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0674  LysR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000302  transcriptional regulator LysR family  25.18 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2073  transcriptional regulator, LysR family protein  27.6 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1544  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3033  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3533  leucine transcriptional activator  25.67 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3403  leucine transcriptional activator  25.67 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2934  leucine transcriptional activator  25.67 
 
 		 322 aa  97.1  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.594963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05202  transcription regulator protein  24.83 
 
 		 304 aa  96.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000103081  normal  0.0105317 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0623  leucine transcriptional activator  26.46 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0252202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2681  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 306 aa  96.3  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0737  LysR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 302 aa  95.5  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210121 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3696  transcriptional regulator, LysR family  27.61 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.643345  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2296  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.671395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2005  transcriptional regulator, LysR family  27.52 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1811  transcriptional regulator, LysR family  27.7 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193528  hitchhiker  0.00243987 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2903  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 345 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  23.26 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00823  leucine transcriptional activator  25.82 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0619  LysR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2749  leucine transcriptional activator  27.96 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03340  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>