More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0649 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00598  predicted DNA-binding transcriptional regulator  98.11 
 
 		 317 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133775  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2997  transcriptional regulator, LysR family  98.11 
 
 		 317 aa  641    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3016  putative DNA-binding transcriptional regulator  98.11 
 
 		 317 aa  641    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0654  putative DNA-binding transcriptional regulator  97.79 
 
 		 317 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000955262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0681  putative DNA-binding transcriptional regulator  98.11 
 
 		 317 aa  641    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0649  putative DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 317 aa  652    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00471226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0717  putative DNA-binding transcriptional regulator  98.42 
 
 		 317 aa  647    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000430698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00587  hypothetical protein  98.11 
 
 		 317 aa  640    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140972  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0676  putative DNA-binding transcriptional regulator  69.4 
 
 		 317 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000759051  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0736  putative DNA-binding transcriptional regulator  69.4 
 
 		 317 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0794  putative DNA-binding transcriptional regulator  69.4 
 
 		 317 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0750  putative DNA-binding transcriptional regulator  69.4 
 
 		 317 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.261288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0690  putative DNA-binding transcriptional regulator  69.09 
 
 		 317 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.869609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1164  putative DNA-binding transcriptional regulator  64.35 
 
 		 317 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.898654  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0624  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0624  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3021  transcriptional regulator, LysR family  30.13 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0655  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3040  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0689  transcriptional regulator, LysR family  30.43 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.555049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0718  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0703  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0636241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1974  LysR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0645  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0764  transcriptional regulator, LysR family  26.8 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0275467  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3412  regulatory protein, LysR  26.98 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.366877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2903  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0659  LysR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2206  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0310  LysR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  26.21 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  26.21 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  26.87 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  27.06 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000302  transcriptional regulator LysR family  26.24 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2073  transcriptional regulator, LysR family protein  26.01 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.71 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  24.57 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3957  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  28.1 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 302 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002655  LysR-like transcriptional regulator  29.2 
 
 		 306 aa  99.8  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0081  leucine transcriptional activator  26.06 
 
 		 314 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.669516  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0078  leucine transcriptional activator  26.06 
 
 		 314 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0131  leucine transcriptional activator  27.84 
 
 		 314 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0678941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0131  leucine transcriptional activator  27.84 
 
 		 341 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0127  leucine transcriptional activator  27.84 
 
 		 314 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0126  leucine transcriptional activator  27.84 
 
 		 314 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  hitchhiker  0.00376656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0084  leucine transcriptional activator  26.67 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0081  leucine transcriptional activator  25.7 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0124  leucine transcriptional activator  27.84 
 
 		 314 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.442889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0674  LysR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0253  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 331 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  26.35 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3640  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.525425  normal  0.47067 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00078  leucine transcriptional activator  26.47 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3523  transcriptional regulator, LysR family  26.47 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3581  leucine transcriptional activator  26.47 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.000946626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00077  hypothetical protein  26.47 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1727  LysR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.986753  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3589  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1282  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.526163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 301 aa  96.3  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 307 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3185  putative transcriptional regulator  26.3 
 
 		 301 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03340  transcriptional regulator  27.6 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 432 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0253  LysR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.88055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  23 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_003296  RS05202  transcription regulator protein  24.13 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000103081  normal  0.0105317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3789  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2018  transcription regulator protein  31.46 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.416664  normal  0.213867 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3033  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 306 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0069  leucine transcriptional activator  25.64 
 
 		 314 aa  92.8  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0519  LysR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 329 aa  92.4  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0623  leucine transcriptional activator  27.14 
 
 		 314 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0252202 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3724  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 307 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4563  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 307 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3800  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 307 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3382  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2296  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.671395 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0158  LysR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000138303  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0794  transcriptional regulator, LysR family protein  23.43 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 305 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>