More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2381 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2514  putative permease  88.86 
 
 		 441 aa  811    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0562758  normal  0.125545 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2381  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  897    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.411675  normal  0.855412 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2618  putative permease  88.86 
 
 		 441 aa  812    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.10698  normal  0.142697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2459  putative permease  88.86 
 
 		 441 aa  811    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0482459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2410  putative permease  88.86 
 
 		 441 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0945591  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2500  putative permease  89.09 
 
 		 441 aa  814    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  38.79 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  40.68 
 
 		 444 aa  296  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  36.3 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  37.27 
 
 		 440 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 445 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  36.72 
 
 		 441 aa  279  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 442 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 443 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 441 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  36.54 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4191  4-hydroxyphenylacetate transporter  33.71 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 442 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  35.95 
 
 		 432 aa  270  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  35.55 
 
 		 444 aa  269  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  35.64 
 
 		 443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  36.41 
 
 		 432 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 444 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04224  hypothetical 4-hydroxyphenylacetate permease  32.78 
 
 		 458 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04190  hypothetical protein  32.78 
 
 		 458 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3708  4-hydroxyphenylacetate transporter  32.78 
 
 		 458 aa  263  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.517033 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1066  4-hydroxyphenylacetate permease  33.65 
 
 		 458 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1171  4-hydroxyphenylacetate permease  33.65 
 
 		 458 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 437 aa  263  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1217  4-hydroxyphenylacetate permease  33.65 
 
 		 458 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4578  4-hydroxyphenylacetate permease  32.78 
 
 		 458 aa  262  8e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1202  4-hydroxyphenylacetate permease  33.65 
 
 		 458 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1182  4-hydroxyphenylacetate permease  33.65 
 
 		 458 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0200  major facilitator family transporter  34.78 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 424 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 		 430 aa  261  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 440 aa  260  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 440 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 440 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  34.21 
 
 		 432 aa  259  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  36 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  34.62 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  35.02 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 440 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 435 aa  256  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 444 aa  255  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  33.99 
 
 		 455 aa  256  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  35.97 
 
 		 432 aa  255  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  36.53 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.17 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  36.53 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 441 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  34.48 
 
 		 445 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 434 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 439 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  34.05 
 
 		 469 aa  253  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 445 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 434 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0261  major facilitator superfamily permease  33.94 
 
 		 441 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  33.33 
 
 		 433 aa  252  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  34.45 
 
 		 469 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0172  major facilitator family transporter  33.94 
 
 		 441 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1636  MFS transporter  33.94 
 
 		 441 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  34.45 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  34.45 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  34.45 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 443 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.45 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  34.45 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6476  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6711  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  33.1 
 
 		 433 aa  250  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 		 433 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 441 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 441 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1641  4-hydroxyphenylacetate permease  33.76 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 440 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 436 aa  247  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 437 aa  247  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 454 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 454 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 428 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>