More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1830 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1830  ribosomal protein S6  100 
 
 		 105 aa  213  9e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1412  30S ribosomal protein S6  53.68 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000404173  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  54.55 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  52.63 
 
 		 101 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  51.04 
 
 		 101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  45.71 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  41.94 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  31.63 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  31.63 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  34 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  30.39 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  33.65 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  27.36 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  27.36 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  31.78 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  33.65 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  30.19 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  28.3 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  28.87 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4668  30S ribosomal protein S6  30.39 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0417729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4877  30S ribosomal protein S6  30.39 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4933  ribosomal protein S6  30.39 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4758  30S ribosomal protein S6  30.39 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0581  30S ribosomal protein S6  30.39 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0534  30S ribosomal protein S6  30.39 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.587814  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4934  30S ribosomal protein S6  30.39 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104766 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0645  30S ribosomal protein S6  30.39 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.793975  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  28.3 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  30 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  29.9 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  28.71 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  28.71 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  28.71 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07640  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368868  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  31.07 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  30.69 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  30.69 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  30.84 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  28.3 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  35.48 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  32.71 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0122  ribosomal protein S6  39.18 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302975  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  32.71 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  29.7 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  27.72 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3592  30S ribosomal protein S6  27.72 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5662  30S ribosomal protein S6  30.39 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3435  30S ribosomal protein S6  27.72 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65180  30S ribosomal protein S6  30.39 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  31.48 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  26.73 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 160 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  27.1 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  28.43 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  30.69 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3586  30S ribosomal protein S6  31.37 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0940753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>