More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1412 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1412  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 101 aa  202  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000404173  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  76.24 
 
 		 101 aa  161  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  75.25 
 
 		 101 aa  158  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  70.83 
 
 		 102 aa  140  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1830  ribosomal protein S6  53.68 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  54.29 
 
 		 106 aa  112  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  37.62 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  40.66 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  35.35 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  37.37 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  34.65 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  29.59 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  29.79 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  36.73 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  30.68 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  34.41 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  31.63 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  28.71 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0125  ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0136  ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0118  SSU ribosomal protein S6P  34.74 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  32.67 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  26.53 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  30.53 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  31.68 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  32.32 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  34.65 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  30.93 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  29.29 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0122  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302975  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  29.29 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  33.66 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  31.68 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  31.68 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  29.41 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  29.7 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  28.28 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  26.32 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  33.66 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  29.9 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  26.67 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  34.34 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  28.89 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  27.72 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  26.53 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0333  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000995265  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  26.53 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  35.35 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  30.69 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  32.18 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0094  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>