More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2590 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 134 aa  274  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  92.54 
 
 		 134 aa  224  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  82.08 
 
 		 151 aa  190  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  81.13 
 
 		 151 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  81.13 
 
 		 151 aa  189  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  82.86 
 
 		 154 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  61.7 
 
 		 155 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  61.7 
 
 		 155 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  70.34 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  67.77 
 
 		 136 aa  170  7.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  71.7 
 
 		 146 aa  167  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  71.17 
 
 		 151 aa  165  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  73.33 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  68.87 
 
 		 153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  71.7 
 
 		 152 aa  160  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  68.27 
 
 		 151 aa  156  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  64.76 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  66.98 
 
 		 153 aa  154  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  66.35 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  66.35 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  65.09 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  65.09 
 
 		 168 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  64.15 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  64.15 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  65.09 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  65.09 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  55.46 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  59.26 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  51.54 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  54.95 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  54.95 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  48.33 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  53.77 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  50.94 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  53.77 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  50.94 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  50.96 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  52.34 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  50.94 
 
 		 117 aa  120  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  46.15 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  44.92 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  44.92 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  43.52 
 
 		 120 aa  91.3  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  38.64 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  40.71 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  42.24 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  37.14 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  40.54 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  36.19 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  41.23 
 
 		 133 aa  88.6  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0582  30S ribosomal protein S6  41.44 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.147466  hitchhiker  0.0000000000000103542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  39.82 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  39.64 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  39.82 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2052  30S ribosomal protein S6  39.69 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2038  30S ribosomal protein S6  40.94 
 
 		 136 aa  86.7  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  37.5 
 
 		 135 aa  87  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  42.16 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  41.67 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  41.88 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  38.06 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  39.02 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  40.78 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  42.16 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  41.67 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2133  30S ribosomal protein S6  39.69 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.226778  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  40.37 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  40.74 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1364  ribosomal protein S6  40 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3037  30S ribosomal protein S6  41.67 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00243043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1526  30S ribosomal protein S6  40.91 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153289  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2830  30S ribosomal protein S6  41.67 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  39.45 
 
 		 124 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2193  30S ribosomal protein S6  39.47 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0141741  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  38.74 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  39.45 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  39.45 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  39.45 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  39.45 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  39.45 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  39.45 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0371  30S ribosomal protein S6  39.02 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.0305615 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 124 aa  84.3  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3351  30S ribosomal protein S6  38.81 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  39.45 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  39.45 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  39.67 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  39.45 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  39.45 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2395  30S ribosomal protein S6  40.74 
 
 		 121 aa  84  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  38.1 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  40.71 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  38.53 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00746  30S ribosomal protein S6  40.95 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  38.53 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0753  30S ribosomal protein S6  35.61 
 
 		 131 aa  83.6  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000769486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>