More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_23360 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  100 
 
 		 95 aa  189  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 98 aa  98.6  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  47.87 
 
 		 95 aa  97.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 95 aa  93.6  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 95 aa  93.6  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  44.68 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  44.68 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  43.48 
 
 		 95 aa  88.2  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 97 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  38.04 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  44.09 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  42.55 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 97 aa  80.1  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  35.11 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  37.23 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07640  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368868  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0675  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000724488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  36.96 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  40.86 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 147 aa  76.6  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  37.23 
 
 		 96 aa  76.6  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 96 aa  76.6  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3930  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0315  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>