More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0951 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 124 aa  241  1.9999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  91.87 
 
 		 125 aa  222  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  91.87 
 
 		 125 aa  222  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  91.06 
 
 		 125 aa  219  7e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  77.68 
 
 		 142 aa  179  9.000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  76.32 
 
 		 139 aa  178  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  72.95 
 
 		 128 aa  176  9e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  74.55 
 
 		 145 aa  171  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  57.72 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  47.62 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  47.12 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  41.67 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  41.84 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  44.09 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  41.58 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  43.01 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0114  30S ribosomal protein S6  46.59 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  45.26 
 
 		 108 aa  76.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0094  30S ribosomal protein S6  46.07 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  36.79 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  34.75 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  45.16 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  37.11 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  33.61 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  39.18 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  38.14 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  43.01 
 
 		 95 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 96 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0107  30S ribosomal protein S6  42.05 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236636  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  33.04 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  43.62 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  43.62 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  36.73 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  43.48 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  37.11 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  36.59 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2512  30S ribosomal protein S6  42.05 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000922964  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  36.73 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4962  ribosomal protein S6  33.66 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  36.73 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  34.11 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0333  30S ribosomal protein S6  37.1 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000995265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0675  30S ribosomal protein S6  39.58 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000724488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0315  30S ribosomal protein S6  43.18 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  31.45 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0147  30S ribosomal protein S6  39.77 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000969846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>