More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0483 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  100 
 
 		 94 aa  188  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 95 aa  93.6  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  43.62 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  44.09 
 
 		 95 aa  90.5  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 95 aa  86.7  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 98 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 96 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 96 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  44.09 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  43.75 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  43.75 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  42.11 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  44.33 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  44.68 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  32.97 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  42.86 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  37.23 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  42.71 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  72  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  36.96 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  41.57 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  35.87 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1046  30S ribosomal protein S6  40.91 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000381184  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4962  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_917  ribosomal protein S6  39.77 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000118903  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0929  30S ribosomal protein S6  39.77 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000641052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>