More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3774 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  100 
 
 		 95 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  44.57 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  44.09 
 
 		 94 aa  90.5  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 95 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  41.11 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  40.86 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  34.04 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0184  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.312972  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0094  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0107  30S ribosomal protein S6  37.08 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236636  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0162  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  31.58 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  34.41 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  31.58 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  32.98 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  33.7 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 94 aa  67  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1046  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000381184  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_917  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000118903  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  31.58 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  29.79 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0158  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000097337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0929  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000641052  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  28.72 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  29.79 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>