More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_917 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_917  ribosomal protein S6  100 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000118903  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1046  30S ribosomal protein S6  98.17 
 
 		 109 aa  219  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000381184  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0929  30S ribosomal protein S6  97.25 
 
 		 109 aa  215  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000641052  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  42.27 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  39.77 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 95 aa  66.6  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  28.12 
 
 		 122 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  36.78 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  35.63 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  32.18 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  30.85 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  35.63 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  29.17 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  28.72 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  34.02 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  32.29 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  33.33 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  31.91 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  35.16 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  28.12 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  32 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  32.18 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  32.18 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  33.33 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3435  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3592  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  25.84 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0371  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.0305615 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  27.66 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0558  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.457125  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>