More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1094 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  100 
 
 		 106 aa  218  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1412  30S ribosomal protein S6  54.29 
 
 		 101 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000404173  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1830  ribosomal protein S6  45.71 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  52.48 
 
 		 101 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  50.5 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  48.42 
 
 		 102 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  38.61 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  36.89 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 96 aa  76.6  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  39.78 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  30.69 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2133  30S ribosomal protein S6  32.35 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.226778  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2052  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  31.82 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  34.74 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  30.43 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 122 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 122 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  34.09 
 
 		 125 aa  67  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1640  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0507943  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  32.95 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3465  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>