More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0022 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  100 
 
 		 97 aa  196  9e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  78.35 
 
 		 97 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  75.26 
 
 		 97 aa  155  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  70.1 
 
 		 97 aa  142  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  54.35 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  54.35 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 		 95 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  43.48 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 95 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  41.67 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  41.3 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  41.3 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  38.54 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  41.67 
 
 		 96 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  36.96 
 
 		 111 aa  76.6  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  41.67 
 
 		 96 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  41.67 
 
 		 96 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  40.62 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0333  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000995265  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  41.3 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0315  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00746  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2589  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  38.04 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  40.66 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  35.87 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  38.14 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2193  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0141741  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>