More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1728 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  100 
 
 
96 aa  194  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  92.63 
 
 
95 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  74.23 
 
 
97 aa  147  6e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  60 
 
 
146 aa  133  9e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  67.02 
 
 
98 aa  133  9e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  65.59 
 
 
96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  65.59 
 
 
96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  65.59 
 
 
96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  65.59 
 
 
96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  65.59 
 
 
96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  65.59 
 
 
96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  62.37 
 
 
98 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  64.52 
 
 
96 aa  128  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  64.52 
 
 
96 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  64.52 
 
 
96 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  63.44 
 
 
96 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  61.29 
 
 
95 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  55.79 
 
 
98 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  55.79 
 
 
98 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  54.74 
 
 
98 aa  117  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  54.26 
 
 
98 aa  117  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  55.91 
 
 
95 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  53.76 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  48.39 
 
 
95 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  48.42 
 
 
95 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  44.21 
 
 
94 aa  90.9  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 
98 aa  87  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  40 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  39.78 
 
 
97 aa  77.8  0.00000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  40.86 
 
 
97 aa  77  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  37.23 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  38.04 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  37.63 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  41.49 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  34.74 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  34.74 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  37.5 
 
 
97 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  35.42 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  34.78 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  37.63 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  38.71 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  36.46 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  37.63 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  36.46 
 
 
96 aa  67  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 
117 aa  67  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  35.11 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  37.89 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  35.42 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  36.46 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  36.56 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  33.33 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0645  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.501453  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  32.63 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  32.98 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  38.3 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  37.63 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>