More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5369 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  100 
 
 		 102 aa  209  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  72.53 
 
 		 94 aa  143  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  73.63 
 
 		 93 aa  143  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  70.21 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  72.04 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  72.04 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  72.04 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  67.37 
 
 		 96 aa  141  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  65.96 
 
 		 96 aa  141  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  66.67 
 
 		 96 aa  140  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  68.82 
 
 		 96 aa  140  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  69.89 
 
 		 96 aa  139  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  69.89 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  66.32 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  66.67 
 
 		 98 aa  139  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  63.16 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  65.59 
 
 		 96 aa  137  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  68.82 
 
 		 96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  65.59 
 
 		 96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  66.67 
 
 		 96 aa  136  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  68.13 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  67.71 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  60.82 
 
 		 98 aa  130  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  65.59 
 
 		 95 aa  130  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  56.84 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  61.54 
 
 		 111 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  61.29 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  59.34 
 
 		 97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  58.95 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  57.89 
 
 		 101 aa  124  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  57 
 
 		 101 aa  120  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4522  30S ribosomal protein S6  66.67 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  50.53 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  54.26 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  55.32 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  52.63 
 
 		 96 aa  114  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  47.96 
 
 		 98 aa  99.8  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  44.09 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  43.01 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  40 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  37.08 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  40.66 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  38.2 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  40.7 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  39.53 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  34.04 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1778  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000639797  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  32.56 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3465  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  38.2 
 
 		 160 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  36.73 
 
 		 147 aa  67  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  38.37 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1057  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.66834 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  33.72 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>