More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4339 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  100 
 
 		 98 aa  195  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  71.88 
 
 		 97 aa  147  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  74.19 
 
 		 96 aa  146  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  76.09 
 
 		 108 aa  145  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  71.28 
 
 		 96 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  71.28 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  70.97 
 
 		 95 aa  141  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  68.04 
 
 		 98 aa  140  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  69.89 
 
 		 96 aa  140  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  74.73 
 
 		 93 aa  139  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  66.67 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  72.53 
 
 		 94 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  69.89 
 
 		 96 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  65.96 
 
 		 96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  67.74 
 
 		 96 aa  138  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  67.02 
 
 		 96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  67.74 
 
 		 101 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  68.82 
 
 		 96 aa  137  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  67.74 
 
 		 96 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  68.82 
 
 		 96 aa  135  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  67.74 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  67.74 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  66.67 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  67.74 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  69.89 
 
 		 96 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  68.82 
 
 		 95 aa  132  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  66.67 
 
 		 96 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  66.3 
 
 		 111 aa  130  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  63.83 
 
 		 118 aa  127  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  62.37 
 
 		 96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4522  30S ribosomal protein S6  75 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  58.06 
 
 		 101 aa  123  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  58.51 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  56.12 
 
 		 101 aa  114  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  55.32 
 
 		 95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  49.45 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  49.48 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  52.13 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  43.96 
 
 		 95 aa  90.5  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  42.86 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  39.58 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  43.68 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6993  ribosomal protein S6  40 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140903 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  33.72 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  38.04 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  36.05 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  40.66 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  31.58 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  36.05 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  31.63 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  37.21 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  33.72 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  38.37 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0574  ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  34.88 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3586  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0940753  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  34.88 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2193  30S ribosomal protein S6  33.72 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0141741  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3037  30S ribosomal protein S6  33.72 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00243043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  34.88 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  37.21 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>