More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0337 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  100 
 
 		 101 aa  203  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  63.37 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  64.65 
 
 		 96 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  62.38 
 
 		 96 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  63.64 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  60.4 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  61.39 
 
 		 96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  63.37 
 
 		 96 aa  130  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  63.37 
 
 		 96 aa  129  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  63.37 
 
 		 96 aa  129  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  63.37 
 
 		 96 aa  129  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  62.38 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  62.89 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  61.62 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  62.63 
 
 		 95 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  59.6 
 
 		 96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  60.61 
 
 		 96 aa  127  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  64.58 
 
 		 111 aa  127  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  59.41 
 
 		 101 aa  127  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  60.4 
 
 		 96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  59.41 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  59.41 
 
 		 98 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  59.6 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  57.43 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  59.6 
 
 		 95 aa  124  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  60.82 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  59.79 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  57 
 
 		 102 aa  120  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  55.67 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  56.12 
 
 		 98 aa  114  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  48.51 
 
 		 101 aa  113  7.999999999999999e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  56.25 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  51.52 
 
 		 95 aa  107  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4522  30S ribosomal protein S6  60.42 
 
 		 108 aa  106  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  51.02 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  45.54 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  42 
 
 		 98 aa  91.3  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  45.83 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  40.21 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  39 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  36 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  35 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  35 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  42.42 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  35.64 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  35.64 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  35.64 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  35.64 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  35.64 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  35.64 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  34 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  34.65 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  34.65 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  34.65 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  34.65 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  39.22 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  38 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  37.11 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  38.24 
 
 		 94 aa  67  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  35 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  32.67 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  36 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  34.34 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  34 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4933  ribosomal protein S6  33 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0581  30S ribosomal protein S6  33 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0534  30S ribosomal protein S6  33 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.587814  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4877  30S ribosomal protein S6  33 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  35.64 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07640  30S ribosomal protein S6  32 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368868  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4758  30S ribosomal protein S6  33 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0645  30S ribosomal protein S6  33 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.793975  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4934  30S ribosomal protein S6  33 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104766 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  35.64 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4668  30S ribosomal protein S6  33 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0417729 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  33.66 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  34.95 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0024  30S ribosomal protein S6  39.39 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  32 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1046  30S ribosomal protein S6  32 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000381184  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_917  ribosomal protein S6  32 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000118903  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0929  30S ribosomal protein S6  34 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000641052  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  31.68 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5662  30S ribosomal protein S6  31 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl080  30S ribosomal protein S6  41 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  1.25992e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  31.68 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65180  30S ribosomal protein S6  31 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  32 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  29.7 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1057  30S ribosomal protein S6  27 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.66834 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  28.87 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  34 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>