More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2540 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  100 
 
 
97 aa  197  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  45.36 
 
 
98 aa  92.8  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  43.75 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  43.3 
 
 
96 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  43.3 
 
 
96 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  47.92 
 
 
96 aa  90.9  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  47.92 
 
 
95 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  45.83 
 
 
95 aa  90.5  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  42.27 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  42.27 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  42.27 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  42.27 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  42.27 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  42.27 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  42.27 
 
 
96 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  42.27 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  46.32 
 
 
94 aa  90.1  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  40.62 
 
 
95 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  40.62 
 
 
95 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  42.11 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 
95 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  45.83 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  42.27 
 
 
98 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  42.27 
 
 
98 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 
95 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4962  ribosomal protein S6  44 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  41.24 
 
 
98 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  42.71 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  40 
 
 
96 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  37.11 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  39.13 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  38.14 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  40.21 
 
 
101 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  42.11 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  39.36 
 
 
93 aa  78.2  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  40.62 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  40.62 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  40.62 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  39.18 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  41.24 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  40.62 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  39.58 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  39.58 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  40.62 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  40 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  41.05 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  37.89 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  39.58 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  39.18 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  40 
 
 
96 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  32.99 
 
 
97 aa  73.6  0.0000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  35.05 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  39.78 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  37.63 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  38.95 
 
 
96 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  39.22 
 
 
101 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  38.95 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  37.11 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  36.08 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  36.84 
 
 
96 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  37.89 
 
 
96 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  37.23 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  41.05 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  32.98 
 
 
98 aa  70.1  0.000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 
96 aa  70.1  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  36.84 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  36.96 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  35.79 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 
96 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  35.42 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0929  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000641052  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  38.54 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 
142 aa  67  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  32.65 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1046  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000381184  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 
96 aa  66.6  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_917  ribosomal protein S6  36.46 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000118903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  34.74 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  36.17 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  34.04 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0675  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000724488  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  31.96 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>